Det hade gått mer än 40 år sedan människorna på dom 12 kolonierna av Kobol stred mot Cylonerna, de medvetna robotarna som vände sig mot sina skapare med ett dödligt slut. Robotarna hade observerat vapenstilleståndet som stoppade Cylonkriget, men dom diplomatiska relationerna mellan människan och maskinerna kom aldrig helt till verklighet. Cylonerna har hållit sig tysta under alla dessa år, och efter ett tag glömdes hotet från dem bort.

När Cylonerna infiltrerat människans försvarssystem, startade dom ett överraskande kärnvapenangrepp som decimerade mänskligheten och hela dess civilisation, och det enda som blev kvar är en samling skepp med överlevande. Ställda inför en strid dom inte kan vinna mot en dödlig fiende, är dom nu tvungna att fly undan sina förföljare.